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只给编译后的.jar文件，不给.java文件
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不过要说明的是，java因为是字节码，所以没有办法防止被反编译。
最多也就是做一下代码混淆，比如把方法或变量名改成无意义的名称，或者加一些完全无用的代码进去，让恶意攻击的人难以看懂
可以的，但是对jar包直接加密，目前只支持J2SE，还不支持J2EE。更多的还是用混编器（java obfuscator）。下面是关于HASP的介绍。
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针对java加密防止反编译的解决方案
众所周知，java开发语言提供了很方便的开发平台，开发出来的程序很容易在不同的平台上被移植，现在越来越多的人使用它来开发软件，与.net语言并驾齐驱。
Java有它方便的一面，同时也给开发者带来了一个不小的烦恼，就是保护程序代码变得困难，因为java语言编译和代码执行的特殊性，目前，除了HASP外，还没有一个更好的解决办法或保护方案，但如果不采取有力的措施，则自己辛辛苦苦开发出来的程序很容易被人复制而据为己有，一般情况下，大多数的人都是用混编器（java obfuscator）来把开发出来的程序进行打乱，以想达到防止反编译的目的，但是，这种方法在网上很容易找到相关的软件来重新整理，那么这个混编器工具也只能控制一些本来就没有办法的人，而对于稍懂工具的人几乎是透明的，没有任何意义。再说硬件加密锁，大多数厂商提供的加密锁只能进行dll的连接或简单的api调用，只要简单地反编译，就很容易把api去掉，这样加密锁根本起不了作用，那到底是否还有更好的解决办法呢？
现提供2种解决办法：
1、以色列阿拉丁公司的HASP HL加密锁提供的外壳加密工具中，有一个叫做数据加密的功能，这个功能可以很好的防止反编译而去掉api的调用，大家知道：硬件加密锁的保护原理就是让加密过的软件和硬件紧密地连接在一起，调用不会轻易地被剔除，这样才能持久地保护您的软件不被盗版，同时，这种方式使用起来非常简单，很容易被程序员掌握，要对一个软件实现保护，大约只需几分钟的时间就可以了，下面简单介绍一下它的原理：
运用HASP HL的外壳工具先把java解释器进行加密，那么，如果要启动这个解释器就需要有特定的加密锁存在，然后，再运用外壳工具中的数据加密功能把java程序(CLASS或JAR包)当作一个数据文件来进行加密处理，生成新的java程序(CLASS或JAR包)，因为这个加密过程是在锁内完成的，并采用了128位的AES算法，这样，加密后的java程序，无论你采用什么样的反编译工具，都是无法反编译出来的。您的软件也只有被加密过的java解释器并有加密锁的情况下才能正常运行，如果没有加密锁，程序不能运行，从而达到真正保护您的软件的目的。
2、HASP HL提供专门针对java外壳加密工具，直接加密jar包，防止外编译，目前只支持J2SE，将来会进一步支持J2EE，如果情况适合则是最简单的方法。
基本的单向加密算法：
BASE64 严格地说，属于编码格式，而非加密算法
MD5(Message Digest algorithm 5，信息摘要算法)
SHA(Secure Hash Algorithm，安全散列算法)
HMAC(Hash Message Authentication Code，散列消息鉴别码)
复杂的对称加密（DES、PBE）、非对称加密算法：
DES(Data Encryption Standard，数据加密算法)
PBE(Password-based encryption，基于密码验证)
RSA(算法的名字以发明者的名字命名：Ron Rivest, AdiShamir 和Leonard Adleman)
DH(Diffie-Hellman算法，密钥一致协议)
DSA(Digital Signature Algorithm，数字签名)
ECC(Elliptic Curves Cryptography，椭圆曲线密码编码学)
代码参考：
/**
* BASE64加密
*
* @param key
* @return
* @throws Exception
*/
public static String encryptBASE64(byte[] key) throws Exception {
return (new BASE64Encoder()).encodeBuffer(key);
}
/**
* MD5加密
*
* @param data
* @return
* @throws Exception
*/
public static byte[] encryptMD5(byte[] data) throws Exception {
MessageDigest md5 = MessageDigest.getInstance(KEY_MD5);
md5.update(data);
return md5.digest();
}
/**
* SHA加密
*
* @param data
* @return
* @throws Exception
*/
public static byte[] encryptSHA(byte[] data) throws Exception {
MessageDigest sha = MessageDigest.getInstance(KEY_SHA);
sha.update(data);
return sha.digest();
}
}
/**
* 初始化HMAC密钥
*
* @return
* @throws Exception
*/
public static String initMacKey() throws Exception {
KeyGenerator keyGenerator = KeyGenerator.getInstance(KEY_MAC);
SecretKey secretKey = keyGenerator.generateKey();
return encryptBASE64(secretKey.getEncoded());
}
/**
* HMAC加密
*
* @param data
* @param key
* @return
* @throws Exception
*/
public static byte[] encryptHMAC(byte[] data, String key) throws Exception {
SecretKey secretKey = new SecretKeySpec(decryptBASE64(key), KEY_MAC);
Mac mac = Mac.getInstance(secretKey.getAlgorithm());
mac.init(secretKey);
return mac.doFinal(data);
}