首先，我觉得这个问题要先从 Vue 的实例开始讲起。Vue 的实例一般都是长成下面这个样子，不同的只是 id 名的不同。
var vm = new Vue({
el: '#app',
data: {},
methods: {}
...
})
这就是 Vue 实例的基本结构，并不陌生。从这里可以看到，el 的指定是一个 id 为 app 的 div 元素，Vue 实例接管了对它的控制，减少了我们的 DOM 操作，需要被 vm 控制的元素全部加在它的内部。如果是需要控制不同的部分，这就需要多个 Vue 的实例来实现。疑问就来了，为什么需要不同的 Vue 实例来接管?
入口问题
在 Vue 中指定 el 选项是给 Vue 实例指定一个 SPA 入口，有可能你的页面会长成像下面这样：
Vue 实例其实并不知道哪一个是入口，它应该接管哪一个部分，所以你要给它指定一个唯一的元素作为入口。每一个入口可以看作是一个 Vue 的类，Vue 要把这个入口进去的所有东西都取出来进行轮循渲染一遍，再把它重新挂载回页面中的 DOM 里面去。打给比方来说，一个 Vue 实例只拥有一个钥匙，一个钥匙只能开一把锁，但是页面上有很多把锁，如果你不说清楚它是哪把锁的钥匙，Vue 实例就不知道接下来要怎么做了。
学习 Vue 不得不说的就是2.0引入的Virtual DOM，引入虚拟 DOM 后，在框架的内部将虚拟 DOM 树型结构与真实 DOM 做了映射，让我们不用再命令式的去操作 DOM。
引用里面的一张图片：
从这张图可以看出来虚拟 DOM 的一个渲染过程，那我们再回到本文的话题：为什么只能由一个根元素？ 我们来看一个例子，假设你的 Vue 实例接管的 DOM 结构长成这个样子：
My title
Content
Other text
它在浏览器内部的表现是一个这样的 DOM 树:
原谅我画图技术差，不过我想展示的效果达到了。从这可以看出它是一个树的结构，每个元素、文字、注释都是一个节点，虚拟 DOM 遵循的也是这样的一个树的数据结构。
回到正题，我们的指定的 el 也就是整个 DOM 结构的根。现在就很好说了，我们只有指定了唯一的 el 根元素，才能交给 Vue 实例在内部通过 createElement 方法生成一个对应的虚拟 DOM 结构映射真实的 DOM 元素进行操作渲染成真正的 HTML
换句话来说，可以把 el 对应的元素理解成 Vue 接管部分中的一个顶级标签，就像基本的 HTML 结构中，顶级标签是 ，只能有一个这样的标签存在。对应到 Vue 中也是这样，如果你给它两个顶级标签，那么对应的 DOM 结构就无法生成了，这也就解释了之前的疑惑：为什么不能指定多个入口让 Vue 实例一个个的试。
