一个比较经典的问题:
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如果线上机器的磁盘占用率超级高,怎么办?
这时候优先想到的肯定是,定位到占用磁盘空间最大的那些文件,然后把可以删的给删掉。
那么,问题来了,如何定位到占用磁盘空间最大的文件?
一个办法是执行如下命令:
里面涉及三个指令:du、sort、more
既然用到了,就顺便多了解一下这三个指令的用法,算是做下个人笔记。
首先是du
作用:用来查看文件所占用的磁盘情况。
格式:du [选项] [文件]
可用选项(如下为du --help展示的内容):
操作示例:
对几个比较常用的选项单独拿出来,在机器上实际操作,效果如下:
首先,当前目录如下:
du:
其实吧,从图里面可以看到,使用“du”的时候,最后一行就当前目录的磁盘使用总量,所以,感觉一般情况下-c这个选项并没有什么用。
du -s:只计算总量
不过,注意:-s与-a不能同时存在,会报错的。
sort
作用:对输出的结果进行排序
可用选项:
-r:代表逆序排序
-n:按照字符串数值排序
-g:按照常规数值排序
-f:忽略字母大小写
实测效果:
首先是测试文件的原始状态:
测试一:sort
可以发现:
空行排在了第一位;
不管数字有多大,字符串都会排在数字的后面;
数字之间排序的时候,优先考虑首位数字(感觉是把数字也当成了一个字符串进行排序);
more
作用:用于一页一页地展示文件内容。
几个常用操作:
空格:翻到下一页
b:翻到上一页
/:启动字符串搜索(类似于vim)
此外:
more +n XXX:从XXX文件的第n行开始展示
more -n XXX:展示XXX文件,并且将n行视为一页,也就是按空格时,只会显示后续的N行
cat
作用:一次性的展示所有文件内容
cat有两个比较有用的选项:
-n:输出所有行号
-b:只对非空行输出行号
此外,
cat支持同时输出多个文件的内容:cat XXX YYYY ZZZZ
并且,cat可以与more结合使用:cat XXX | more 或者 cat XXX YYYY ZZZZ | more 或者 cat -n XXX | more
less:
作用:对文件或者输出内容进行分页展示,并且less可以用于打开多个文件
常用操作:
j:向上滚动一行
k:向下滚动一行(类似于vim)
g:跳到第一行
G:跳到最后一行
b:向上翻一页
空格:翻页
n%:跳转到整个文件的n%处
:e :在使用less打开多个文件时,使用“:e”选择跳转到其他文件去
/:进行字符串搜索
v:启动编辑
常用选项:
-N:在每一行前面都显示行号
-m:显示读取文件的百分比
-M:显示读取文件的百分比、行号和总行数
注意:
其他两个比较简单的指令:
head:显示一个文件的前N行
用法:head -n 行数 文件名
tail:显示一个文件的最后N行
用法:tail -n 行数 文件名
不过,使用tai的时候,因为-f选项可以自动显示新增加的内容,所以经常会使用如下方式:
tail -f 文件名
1、date:打印或者设置系统的日期和时间。
2、stty-a:可以查看或者打印控制字符(Ctrl-C、Ctrl-D、Ctrl-Z等)。
3、passwd:用passwd-h查看。
4、logout,login:登录shell的登录和注销命令。
5、more,less,headtail:显示或部分显示文件内容。
6、lp/lpstat/cancel,lpr/lpq/lprm:打印文件。
7、chmodu+x:更改文件权限。
8、rm-frdir:删除非空目录。
9、cp-Rdir:拷贝目录。
linux中命令cat、more、less均可用来查看文件内容,主要区别有:
1、cat是一次性显示整个文件的内容,还可以将多个文件连接起来显示,它常与重定向符号配合使用,适用于文件内容少的情况。
cat主要有三大功能:
2、more命令,功能类似 cat ,cat命令是整个文件的内容从上到下显示在屏幕上。 more会以一页一页的显示方便使用者逐页阅读,而最基本的指令就是按空白键(space)就往下一页显示,按 b 键就会往回(back)一页显示,而且还有搜寻字串的功能 。more命令从前向后读取文件,因此在启动时就加载整个文件。
常用操作命令:
3、less 工具也是对文件或其它输出进行分页显示的工具,应该说是linux正统查看文件内容的工具,功能极其强大。less 的用法比起 more 更加的有弹性。在 more 的时候,我们并没有办法向前面翻, 只能往后面看,但若使用了 less 时,就可以使用 [pageup] [pagedown] 等按键的功能来往前往后翻看文件,更容易用来查看一个文件的内容!除此之外,在 less 里头可以拥有更多的搜索功能,不止可以向下搜,也可以向上搜,而且 less 在查看之前不会加载整个文件。
常用操作命令:
less [参数] 文件:
less命令非常强大,在此只介绍几个常用的参数,更多参数可使用man less来查看帮助。
1)查看文件
2)一次查看多个文件
说明:
输入 :n后,切换到linuxdaxue.com-error_log
输入 :p 后,切换到linuxdaxue.com-access_log
接下来给大家介绍一些在less命令比较常用的操作命令,希望大家能够熟练掌握。
1)分屏导航
2)单行导航
3)其它导航
4)其它命令
5)标记导航
当使用 less 查看内容比较多的文件时,可以作一个标记,然后就能通过命令导航到标有特定标记的文本位置,方式如下所示:
在Linux系统里常用于文本查看、操作、统计的命令:
通过多敲键盘,形成手感 肌肉记忆 ,熟练掌握这些命令,在以后生信分析中游刃有余。以下是每个命令的详细的介绍(主要是跟着 生信技能树小郭老师 学习做的笔记)
接下来通过示例把10个命令的常用参数和用法展示出来:
参数的用法介绍:
注意事项:
用 cat 命令可以 查看文本 ,也可以 编辑文本 ,编辑文本要加 符号,退出时,另起一行,按 control C 退出
zcat可以查看压缩的文本文件,tac逆向查看
结合 管道符| 使用
head / tail -n :查看文件的前 / 后 n 行,默认 10 行 (在R语言里head和tail默认是前6行)。
less命令用得最多 ,more命令用得比较少
3.1 less命令
less [参数] 文件名
less命令重要的补充用法1 :
需要注意 退出 :只要使用less命令, 按q键
less命令重要的补充用法2 :
参数用法:
less命令 不加参数 查看文件:
less命令加 -N参数 查看文件:显示行号
less命令加 -S参数 查看文件:单行显示,非常规整
对比:less和cat命令显示文本行号的用法:less -N,cat -n
3.2 more命令
**more ** 逐页查看,按空格翻页,按回车换行 ,more命令一般很少用,熟练掌握less命令就好
查看压缩文件
wc 统计字符是也把换行符统计进去,但是别的命令不一定会把换行符算进去,。
常见参数:
切记:用less命令,按q退出
cut命令是按关键词来切的
常见参数:
排列前:
排列后:
解释:1和0比,1大;7和0比,7大…在sort字典排序里,100816比1737小,所以100816排在前面。
命令行查看一个表格结构时,因为制表符对齐的原因,出现一个错位的现象。还有 字典排序 可能和我们平时的认知不一样,所以 加上-n参数 , 让数值有数学意义上的大小来排序 。
uniq命令去重,只有两行出现重复,而且是相邻的两行,如果不相邻,即使出现两行一模一样,不会去重。
uniq命令通常和sort命令搭配使用
换其它文件试试
总之,uniq命令使用时经常和sort一起
常见参数:
常见用法1:
paste file1 file2
-s :按行合并 演示
常见用法2 : paste - -
常见参数:
要养成一个好习惯,原始数据不要轻易修改,修改的东西另外保存,文本保存用 (重定向)或是 (追加)
1. 用 less 查看 example.gtf ,然后管道符传递给 wc
2. 截取 example.gtf 第 9 列的内容
3. 在第2步的基础上截取分号分割的第1列
4. 在第3步的基础上排序、去重复并统计
5. 在第4步的基础上,将空格替换成制表符
补充小知识 :
清屏 :control L
查看历史(输入过的)命令 :history