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损坏mysql数据表的索引
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mysql表索引被破坏的问题及解决
下午上班，惊闻我的dedecms的网站出问题了，访问一看，果然全屏报错，检查mysql日志，错误信息为：
Table '.\dedecmsv4\dede_archives' is marked as crashed and should be repaired
提示说cms的文章表dede_archives被标记有问题，需要修复。于是赶快恢复历史数据，上网查找原因。最终将问题解决。解决方法如下：
找到mysql的安装目录的bin/myisamchk工具，在命令行中输入：
myisamchk -c -r ../data/dedecmsv4/dede_archives.MYI
然后myisamchk 工具会帮助你恢复数据表的索引。重新启动mysql，问题解决。
问题分析：
1、错误产生原因，有网友说是频繁查询和更新dede_archives表造成的索引错误，因为我的页面没有静态生成，而是动态页面，因此比较同意
这种说法。还有说法为是MYSQL数据库因为某种原因而受到了损坏，如：数据库服务器突发性的断电、在提在数据库表提供服务时对表的原文件
一、背景
近期，公司RDS云产品的MySQL Server版本进行升级，由目前使用的5.7.26版本升级到最新版本5.7.31；升级后测试同学发现：在MySQL创建用户后，5.7.31版本重新启动集群会出现启动失败的现象；而5.7.26版本在相同测试场景下是正常启动的。这到底是为什么呢?
二、问题复现
2.1 实验环境
2.2 操作步骤
按照测试同学的测试步骤，首先创建一个用户：
然后关闭mysqld；这里需要介绍一下，我们集群的关闭方式是如下方式：
这种方式的内部实现类似于kill -9模式。所以我在线下环境使用kill -9的方式来复现，操作如下：
然后重启mysqld，操作如下：
此时问题复现了，mysqld启动失败，我们查看了下error日志，信息如下：
根据报错信息可以看出:MySQL的权限系统表发生了损坏，导致了mysqld启动失败；由于在MySQL 5.7及其之前版本该表是MyISAM引擎，且该引擎不支持事务，所以在mysqld异常崩溃会导致该类型引擎表的损坏;但在mysqld启动时是有参数控制MyISAM引擎的恢复模式，且该参数在我们产品中也配置到了my.cnf中，如下所示：
2.3 参数解析
对于该参数的官方文档的解释如下：
设置MyISAM存储引擎恢复模式。选项值是OFF、DEFAULT、BACKUP、FORCE或QUICK的值的任意组合。如果指定多个值，请用逗号分隔。指定不带参数的选项与指定DEFAULT相同，指定显式值" "将禁用恢复(与OFF值相同)。如果启用了恢复，则mysqld每次打开MyISAM表时，都会检查该表是否标记为已崩溃或未正确关闭。(只有在禁用外部锁定的情况下运行，最后一个选项才起作用。)在这种情况下，mysqld在表上运行检查。如果表已损坏，mysqld将尝试对其进行修复。
服务器自动修复表之前，它将有关修复的注释写到错误日志中。如果您希望能够在无需用户干预的情况下从大多数问题中恢复，则应使用选项BACKUP，FORCE。即使某些行将被删除，这也会强制修复表，但是它将旧的数据文件保留为备份，以便您以后可以检查发生了什么。
全局变量，只读变量，默认为OFF。
三、问题修复
这类MySQL用户表损耗的问题解决方式也是有多种，我这里列举其中一种：
（1）my.cnf中的[mysqld]标签下添加skip_grant_tables，启动时跳过加载系统字典。
（2）重启mysqld，然后修复mysql schema下的所有表。
（3）在[mysqld]标签下注释或删除掉skip_grant_tables，然后重启mysqld。
此时mysqld是可以正常启动的，无异常。
四、深入排查
在产品化中，以上修复方式很不优雅，只是作为临时的解决方案;并且也存在一些令人疑惑的点：
带着这些疑问，我们继续排查出现该现象的原因；此时Google也没有找到一些有效的信息，那么只能通过MySQL源代码来寻找一些答案。
首先需要下载mysql 5.7.31版本的源代码，并搭建mysql debug环境；具体步骤可以自动Google搜索一下，本文就不再赘述了。
在源代码中搜索一下关键词，用于打断点的位置，然后进行调试：
定位到相关代码，大概是sql/mysqld.cc的4958行，且存在if条件判断，此时我们开始调试：
通过以上调试信息，可以判断出acl_init函数返回的值为真;此时我们查看该函数的代码 (sql/auth/sql_auth_cache.cc:1365)：
根据该函数的注释发现：该函数是初始化负责用户/数据库级特权检查的结构，并从mysql schema中的表中为其加载特权信息；且return值为1代表的是初始化权限失败。
此后开始逐步调试，观察return相关信息，当调试到lock_table_names函数时，我们发现在Phase 3时return值为true，且根据代码注释发现true代表是Failure；具体代码如下(sql/sql_base.cc:5549)：
调试信息如下：
可以看到flags的值为0，而MYSQL_OPEN_SKIP_SCOPED_MDL_LOCK为宏定义值0x1000，与flags的值 做按位与操作，结果自然也是0，当然MYSQL_LOCK_IGNORE_GLOBAL_READ_ONLY也是如此;need_global_read_lock_protection是bool类型值，代表是否需要全局读锁的保护，这个值是在table- mdl_request.type不为MDL_SHARED_READ_ONLY发生改变;check_readonly函数相关信息 下面概述。
此时也查看了下MySQL 5.7.26版本代码作为对比，发现lock_table_names函数下的Phase 3后的部分代 码是在5.7.29版本后新增的。如果是git clone的MySQL代码可以用git blame命令查询文件变化的信息：
上述展示的信息中，最左侧的列值为commit id为05824063和0405ebee，有兴趣的同学可以详细看下。
此功能解决的问题是 BUG#28438114: SET READ_ONLY=1 SOMETIMES DOESN'T BLOCK CONCURRENT DDL.；当然这个代码的变更功能也在5.7 Release Notes中有所体现，如下所示( m/doc/relnotes/mysql/5.7/en/news-5-7-29.html )：
最后我们再查看下check_readonly函数，该函数是基于read_only和super_read_only状态执行标准化检查，是禁止(TRUE)还是允许(FALSE)操作。代码如下(sql/auth/sql_authorization.cc:489)：
此时第一反应就是去检查my.cnf中是否包含read_only相关参数，检查之后发现确实是使用了该参数， 如下：
此时注释掉该参数，然后再次启动mysqld，发现MyISAM表可以自动修复，且正常启动；error log信息如下：
由于docker一些限制，我们在mysqld启动会涉及两次;所以解决该问题的方式为：第一次mysqld的启动时先关闭read_only参数，第二次启动时开启read_only参数。之所以选择默认开启read_only参数， 是为了避免在mysqld启动后，选主逻辑未完成时的保护措施；当然选主完成后，会自动对master执行 set global read_only=0 操作。
五、总结
六、附录
调试的栈帧信息如下，有兴趣的小伙伴可以研究下：
熟悉MySQL体系结构和innodb存储引擎工作原理；以及MySQL备份恢复、复制、数据迁移等技术；专注于MySQL、MariaDB开源数据库，喜好开源技术。
原文链接：
可以使用语句检查表。如果结果的msg_text部分是好的，那么你的表是健康的。反之，则表明mysql数据库中的表有损坏。另外有些厉害的高手一额可以通过运行脚本来检测。
MyISAM 表可以采用以下方法进行修复 ：使用 reapair table 或myisamchk 来修复。如果修复无效，采用备份恢复表。
阶段1 ：检查你的表
如果你有很多时间，运行myisamchk *.MYI 或myisamchk -e *.MYI 。使用-s （沉默）选项禁止不必要的信息。如果mysqld 服务器处于宕机状态，应使用--update-state 选项来告诉myisamchk 将表标记为' 检查过的' 。
你必须只修复那些myisamchk 报告有错误的表。对这样的表，继续到阶段2 。如果在检查时，你得到奇怪的错误( 例如out of memory 错误) ，或如果myisamchk 崩溃，到阶段3 。
阶段2 ：简单安全的修复
注释：如果想更快地进行修复，当运行myisamchk 时，你应将sort_buffer_size 和Key_buffer_size 变量的值设置为可用内存的大约25% 。
首先，试试myisamchk -r -q tbl_name(-r -q 意味着“ 快速恢复模式”) 。这将试图不接触数据文件来修复索引文件。如果数据文件包含它应有的一切内容和指向数据文件内正确地点的删除连接，这应该管用并且表可被修复。开始修复下一张表。否则，执行下列过程：
在继续前对数据文件进行备份。使用myisamchk -r tbl_name(-r 意味着“ 恢复模式”) 。这将从数据文件中删除不正确的记录和已被删除的记录并重建索引文件。
如果前面的步骤失败，使用myisamchk --safe-recover tbl_name 。安全恢复模式使用一个老的恢复方法，处理常规恢复模式不行的少数情况( 但是更慢) 。如果在修复时，你得到奇怪的错误( 例如out of memory 错误) ，或如果myisamchk 崩溃，到阶段3 。
阶段3 ：困难的修复
只有在索引文件的第一个16K 块被破坏，或包含不正确的信息，或如果索引文件丢失，你才应该到这个阶段。在这种情况下，需要创建一个新的索引文件。按如下步骤操做：
把数据文件移到安全的地方。使用表描述文件创建新的( 空) 数据文件和索引文件：
shell mysql db_name
mysql SET AUTOCOMMIT=1;
mysql TRUNCATE TABLE tbl_name;
mysql quit
如果你的MySQL 版本没有TRUNCATE TABLE ，则使用DELETE FROM tbl_name 。将老的数据文件拷贝到新创建的数据文件之中。回到阶段2 。现在myisamchk -r -q 应该工作了。你还可以使用REPAIR TABLE tbl_name USE_FRM ，将自动执行整个程序。
阶段4 ：非常困难的修复
只有.frm 描述文件也破坏了，你才应该到达这个阶段。这应该从未发生过，因为在表被创建以后，描述文件就不再改变了。
从一个备份恢复描述文件然后回到阶段3 。你也可以恢复索引文件然后回到阶段2 。对后者，你应该用myisamchk -r 启动。
如果你没有进行备份但是确切地知道表是怎样创建的，在另一个数据库中创建表的一个拷贝。删除新的数据文件，然后从其他数据库将描述文件和索引文件移到破坏的数据库中。这样提供了新的描述和索引文件，但是让.MYD 数据文件独自留下来了。回到阶段2并且尝试重建索引文件。