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ps 命令的作用是显示进程信息的；
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| 符号，是个管道符号，表示ps 和 grep 命令同时执行；
grep 命令是查找（Global Regular Expression Print），能使用正则表达式搜索文本，然后把匹配的行显示出来；
ps命令有一些参数：
-e : 显示所有进程
-f : 全格式
-h : 不显示标题
-l : 长格式
-w : 宽输出
a ：显示终端上的所有进程，包括其他用户的进程。
r ：只显示正在运行的进程。
u ：以用户为主的格式来显示程序状况。
x ：显示所有程序，不以终端机来区分。
结果信息从前到后依次是：
UID PID PPID C STIME TTY TIME CMD
zzw 14124 13991 0 00:38 pts/0 00:00:00 grep –color=auto dae
Linux中的top命令显示系统上正在运行的进程。它是系统管理员最重要的工具之一。被广泛用于监视服务器的负载。top命令是一个交互命令。在运行top的时候还可以运行很多命令。
N – 以 PID 的大小的顺序排列表示进程列表
P – 以 CPU 占用率大小的顺序排列进程列表
M – 以内存占用率大小的顺序排列进程列表
q – 退出 top
h – 帮助
1 系统运行时间和平均负载
这些字段显示：当前时间、系统已运行的时间、当前登录用户的数量、相应最近5、10和15分钟内的平均负载。
2 任务
第二行显示的是任务或者进程的总结。进程可以处于不同的状态。这里显示了全部进程的数量。除此之外，还有正在运行、睡眠、停止、僵尸进程的数量（僵尸是一种进程的状态）。这些进程概括信息可以用’t’切换显示。
3 CPU 状态
下一行显示的是CPU状态。 这里显示了不同模式下的所占CPU时间的百分比。这些不同的CPU时间表示:
us, user： 运行(未调整优先级的) 用户进程的CPU时间
sy，system: 运行内核进程的CPU时间
ni，niced：运行已调整优先级的用户进程的CPU时间
wa，IO wait: 用于等待IO完成的CPU时间
hi：处理硬件中断的CPU时间
si: 处理软件中断的CPU时间
st：这个虚拟机被hypervisor偷去的CPU时间（译注：如果当前处于一个hypervisor下的vm，实际上hypervisor也是要消耗一部分CPU处理时间的）。
4 内存使用
接下来两行显示内存使用率，有点像’free’命令。第一行是物理内存使用，第二行是虚拟内存使用(交换空间)。
物理内存显示如下:全部可用内存、已使用内存、空闲内存、缓冲内存。相似地：交换部分显示的是：全部、已使用、空闲和缓冲交换空间。
5 各列的意思
PID 进程ID，进程的唯一标识符
USER 进程所有者的实际用户名。
PR 进程的调度优先级。这个字段的一些值是’rt’。这意味这这些进程运行在实时态。
NI 进程的nice值（优先级）。越小的值意味着越高的优先级。
VIRT 进程使用的虚拟内存。
RES 驻留内存大小。驻留内存是任务使用的非交换物理内存大小。
SHR SHR是进程使用的共享内存。
S 这个是进程的状态。它有以下不同的值:
D – 不可中断的睡眠态。
R – 运行态
S – 睡眠态
T – 被跟踪或已停止
Z – 僵尸态
%CPU 自从上一次更新时到现在任务所使用的CPU时间百分比。
%MEM 进程使用的可用物理内存百分比。
TIME+ 任务启动后到现在所使用的全部CPU时间，精确到百分之一秒。
COMMAND 运行进程所使用的命令。
注意 ：不同发行版的top命令在各种细节有不同，如果发现不同时，请读你的帮助手册和命令内的帮助。）
kill、kill-15、kill-9区别:
执行kill（默认kill -15）命令，系统会发送一个SIGTERM信号给对应的程序,大部分程序接收到SIGTERM信号后，会先释放自己的资源，然后再停止。用法kill pid。
kill -15 pid。
kill -9命令，系统给对应程序发送的信号是SIGKILL，即exit。exit信号不会被系统阻塞，所以kill -9能顺利杀掉进程。用法kill -9 pid。
tail -n 1000：显示最后1000行
tail -n +1000：从1000行开始显示，显示1000行以后的
head -n 1000：显示前面1000行
cat a.txt 显示文件
vim xx.conf 编辑文件
打开文件后，按insert键进入编辑模式；编辑完后，按esc建退出编辑模式；按shift+冒号后，输入wq保存退出，wq!保存强制退出，q不保存退出
在根目录模糊查找名字含java的文件
服务器端常有很多压缩过的日志文件，当需要查找日志中某些特定信息的时候，为了避免解压文件，可以使用zgrep，zcat等命令查找、查看压缩文件中的信息
zgrep ' 输入你要查找的东东' /目录 /文件 .gz 或者.log （当日）
grep ' 输入你要查找的东东' /目录 /文件 .gz 或者.log （非当日的压缩文件）
例如： zgrep 'callMktCamLoad' app.log.2019-12-03-*.gz
rpm包安装的，可以用 rpm -qa 看到，如果要查找某软件包是否安装，用 rpm -qa | grep "软件或者包的名字"
以deb包安装的，可以用 dpkg -l 看到。如果是查找指定软件包，用 dpkg -l | grep "软件或者包的名字"
yum方法安装的，可以用 yum list installed 查找，如果是查找指定包，用 yum list installed | grep "软件名或者包名"
在Linux系统里常用于文本查看、操作、统计的命令：
通过多敲键盘，形成手感 肌肉记忆 ，熟练掌握这些命令，在以后生信分析中游刃有余。以下是每个命令的详细的介绍（主要是跟着 生信技能树小郭老师 学习做的笔记）
接下来通过示例把10个命令的常用参数和用法展示出来：
参数的用法介绍：
注意事项：
用 cat 命令可以 查看文本 ，也可以 编辑文本 ，编辑文本要加 符号，退出时，另起一行，按 control C 退出
zcat可以查看压缩的文本文件，tac逆向查看
结合 管道符| 使用
head / tail -n :查看文件的前 / 后 n 行，默认 10 行 （在R语言里head和tail默认是前6行）。
less命令用得最多 ，more命令用得比较少
3.1 less命令
less [参数] 文件名
less命令重要的补充用法1 ：
需要注意 退出 ：只要使用less命令， 按q键
less命令重要的补充用法2 ：
参数用法：
less命令 不加参数 查看文件：
less命令加 -N参数 查看文件：显示行号
less命令加 -S参数 查看文件：单行显示，非常规整
对比：less和cat命令显示文本行号的用法：less -N，cat -n
3.2 more命令
**more ** 逐页查看，按空格翻页，按回车换行 ，more命令一般很少用，熟练掌握less命令就好
查看压缩文件
wc 统计字符是也把换行符统计进去，但是别的命令不一定会把换行符算进去，。
常见参数:
切记：用less命令，按q退出
cut命令是按关键词来切的
常见参数:
排列前：
排列后：
解释：1和0比，1大；7和0比，7大…在sort字典排序里，100816比1737小，所以100816排在前面。
命令行查看一个表格结构时，因为制表符对齐的原因，出现一个错位的现象。还有 字典排序 可能和我们平时的认知不一样，所以 加上-n参数 ， 让数值有数学意义上的大小来排序 。
uniq命令去重，只有两行出现重复，而且是相邻的两行，如果不相邻，即使出现两行一模一样，不会去重。
uniq命令通常和sort命令搭配使用
换其它文件试试
总之，uniq命令使用时经常和sort一起
常见参数:
常见用法1：
paste file1 file2
-s :按行合并 演示
常见用法2 : paste - -
常见参数:
要养成一个好习惯，原始数据不要轻易修改，修改的东西另外保存，文本保存用 (重定向)或是 (追加)
1. 用 less 查看 example.gtf ，然后管道符传递给 wc
2. 截取 example.gtf 第 9 列的内容
3. 在第2步的基础上截取分号分割的第1列
4. 在第3步的基础上排序、去重复并统计
5. 在第4步的基础上，将空格替换成制表符
补充小知识 ：
清屏 ：control L
查看历史（输入过的）命令 ：history
1.grep：找出文件中含有关键字的行
2.cat:读取，显示或拼接文件内容
3.head:查看文件前多少行，默认为10行
4.less:使文件内容可以翻页显示，按q退出观看模式
5.sed :文本替换
6.vi:创建文件并写入内容
点击键盘上的“i”键，进入编辑状态 ，如果看到底部出现“插入”两字，表示成功进入编辑状态，此时就可以在文件中输入你想要输入的内容了
输入想插入的内容，输入完成后点击键盘上的“esc”键，退出编辑
输入:wq,点击回车，退出并保存
查看刚才是否些文件成功
7.%操作符，#操作符：根据拓展名切分文件名，“名称.扩展名”
有一些脚本是依据文件名进行各种处理的。我们可能会需要在保留扩展名的同时修改文件名，转换文件格式或提取部分文件名。
学习Linux系统，命令是最基础的一部分，有着很重要的地位，所以入门必须掌握好常用命令。下面由我为大家整理了Linux系统常用的基本命令入门篇，希望对大家有帮助!
Linux系统常用的基本命令入门篇一、基础命令
1.Linu x的进 入与退出系统
进入Linux系统：
必须要输入用户的账号，在系统安装过程中可以创建以下两种帐号：
1.root--超级用户帐号(系统管理员)，使用这个帐号可以在系统中做任何事情。
2.普通用户--这个帐号供普通用户使用，可以进行有限的操作。
一般的Linux使用者均为普通用户，而系统管理员一般使用超级用户帐号完成一些系统管理的工作。如果只需要完成一些由普通帐号就能完成的任务，建议不要使用超级用户帐号，以免无意中破坏系统。影响系统的正常运行。
用户登录分两步：第一步，输入用户的登录名，系统根据该登录名识别用户;第二步，输入用户的口令，该口令是用户自己设置的一个字符串，对其他用户是保密的，是在登录时系统用来辨别真假用户的关键字。
当用户正确地输入用户名和口令后，就能合法地进入系统。屏幕显示：
[root@loclhost/root] #
这时就可以对系统做各种操作了。注意超级用户的提示符是ldquo;#rdquo;，其他用户的提示符是ldquo;$rdquo;。
2.修改口令
为了更好的保护用户帐号的安全，Linux允许用户随时修改自己的口令，修改口令的命令是passwd，它将提示用户输入旧口令和新口令，之后还要求用户再次确认新口令，以避免用户无意中按错键。如果用户忘记了口令，可以向系统管理员申请为自己重新设置一个。
3.虚拟控制台
Linux是一个真正的多用户 操作系统 ，它可以同时接受多个用户登录。Linux还允许一个用户进行多次登录，这是因为Linux和UNIX一样，提供了虚拟控制台的访问方式，允许用户在同一时间从控制台进行多次登录。虚拟控制台的选择可以通过按下Alt键和一个功能键来实现，通常使用F1-F6例如，用户登录后，按一下Alt-F2键，用户又可以看到"login:"提示符，说明用户看到了第二个虚拟控制台。然后只需按Alt-F1键，就可以回到第一个虚拟控制台。 一个新安装的Linux系统默认允许用户使用Alt-F1到Alt-F6键来访问前六个虚拟控制台。虚拟控制台可使用户同时在多个控制台上工作，真正体现Linux系统多用户的特性。用户可以在某一虚拟控制台上进行的工作尚未结束时，切换到另一虚拟控制台开始另一项工作。
退出系统
不论是超级用户，还是普通用户，需要退出系统时，在shell提示符下，键入exit命令即可。
4.查看命令帮助信息
man命令
man命令用于查询命令和程序的使用 方法 和参数。
例如：
man ls
将显示ls命令的基本格式和使用方法
Linux系统常用的基本命令入门篇二、关机重启命令
首先，是关机/重启命令，仅在虚拟机时使用，实际工作中用不到
reboot 一般不跟参数使用，输入指令即可重启
shutdown 一般需要跟参数，例：
shutdown -r 延时多少分钟重启，一般使用now
shutdown -r now 立即重启
shutdown -f 强制重启
跟windows一样，linux也存在注销功能
exit
1)halt
halt 可不接参数
halt -f 强制关机
2)poweroff
poweroff 可不接参数使用
poweroff -f 强制关机
3)init 0
4)shutdown 不可单独使用
shutdown -h 分钟数 延时多久关机
shutdown -h now 立即关机
Linux系统常用的基本命令入门篇三、vi编辑
vi命令是UNIX操作系统和类UNIX操作系统中最通用的全屏幕纯文本编辑器。
Linux中的vi编辑器叫vim，它是vi的增强版(vi Improved)，与vi编辑器完全兼容，而且实现了很多增强功能。
vi编辑器支持编辑模式和命令模式，编辑模式下可以完成文本的编辑功能，命令模式下可以完成对文件的操作命令，要正确使用vi编辑器就必须熟练掌握着两种模式的切换。
默认情况下，打开vi编辑器后自动进入命令模式。从编辑模式切换到命令模式使用ldquo;escrdquo;键，从命令模式切换到编辑模式使用ldquo;Ardquo;、ldquo;ardquo;、ldquo;Ordquo;、ldquo;ordquo;、ldquo;Irdquo;、ldquo;irdquo;键。
vi编辑器提供了丰富的内置命令，有些内置命令使用键盘组合键即可完成，有些内置命令则需要以冒号ldquo;：rdquo;开头输入。常用内置命令如下：
1 Ctrl+u：向文件首翻半屏;
2 Ctrl+d：向文件尾翻半屏;
3 Ctrl+f：向文件尾翻一屏;
4 Ctrl+b：向文件首翻一屏;
5 Esc：从编辑模式切换到命令模式;
6 ZZ：命令模式下保存当前文件所做的修改后退出vi;
7 :行号：光标跳转到指定行的行首;
8 :$：光标跳转到最后一行的行首;
9 x或X：删除一个字符，x删除光标后的，而X删除光标前的;
10 D：删除从当前光标到光标所在行尾的全部字符;
11 dd：删除光标行正行内容;
12 ndd：删除当前行及其后n-1行;
13 nyy：将当前行及其下n行的内容保存到寄存器?中，其中?为一个字母，n为一个数字;
14 p：粘贴文本操作，用于将缓存区的内容粘贴到当前光标所在位置的下方;
15 P：粘贴文本操作，用于将缓存区的内容粘贴到当前光标所在位置的上方;
16 /字符串：文本查找操作，用于从当前光标所在位置开始向文件尾部查找指定字符串的内容，查找的字符串会被加亮显示;
17 ?name：文本查找操作，用于从当前光标所在位置开始向文件头部查找指定字符串的内容，查找的字符串会被加亮显示;
18 a，bs/F/T：替换文本操作，用于在第a行到第b行之间，将F字符串换成T字符串。其中，ldquo;s/rdquo;表示进行替换操作;
19 a：在当前字符后添加文本;
20 A：在行末添加文本;
21 i：在当前字符前插入文本;
22 I：在行首插入文本;
23 o：在当前行后面插入一空行;
24 O：在当前行前面插入一空行;
25 :wq：在命令模式下，执行存盘退出操作;
26 :w：在命令模式下，执行存盘操作;
27 :w!：在命令模式下，执行强制存盘操作;
28 :q：在命令模式下，执行退出vi操作;
29 :q!：在命令模式下，执行强制退出vi操作;
30 :e文件名：在命令模式下，打开并编辑指定名称的文件;
31 :n：在命令模式下，如果同时打开多个文件，则继续编辑下一个文件;
32 :f：在命令模式下，用于显示当前的文件名、光标所在行的行号以及显示比例;
33 :set nu：在命令模式下，用于在最左端显示行号;
34 :set nonu：在命令模式下，用于在最左端不显示行号;
35 :1,3y 复制第一行到第三行
36 :1,3d 删除第一行到第三行
37 :1,3s/str/str_new/g 替换第一行到第三行中的字符串
38 :1,3s/str/str_new 替换第一行到第三行中的字符串第一个字符
39 :1,3 g/str /d 删除第一行到第三行中含有这个字符串的行
Linux常用命令一、查询相关
find
按规则查找某个文件或文件夹，包括子目录
find . -name '_sh' -- 以.sh结尾的文件
find . -name '_hannel_ -- 包含channel字符的文件
find . -name 'build_ -- 以build开头的文件
find . -name 'abc??' -- abc后面有两个字符的文件
grep
查找内容包含指定的范本样式的文件，Global Regular Expression Print
grep -n pattern files -- 规则 -n表示显示行号
grep -n 'PostsActivity' AndroidManifest.xmlgrep -n '\d' AndroidManifest.xmlgrep 'aapt' build-channel.xml -- 文件中包含字符串的所有地方
grep -n 'aapt' build-channel.xml -- 文件中包含字符串的所有地方，并显示行号
ps -e | grep java -- 所有java进程
ps -e | grep -i qq --所有qq进程，不区分大小写
find . -name '_hannel.xml' | xargs grep -n 'aapt' -- 在以channel.xml结尾的文件中查找包含lsquo;aaptrsquo;关键字的地方
ls | grep 'channel' -- 包含channel关键字的文件
which
在PATH变量指定的路径中，搜索某个系统命令的位置，并且返回第一个搜索结果
which zipwhich grep
Linux常用命令二、查看命令
tail
tail [-f] [-c Number | -n Number | -m Number | -b Number | -k Number] [File]
从指定点开始将文件写到标准输出。使用tail命令的-f选项可以方便的查阅正在改变的日志文件，tail -f filename会把filename里最尾部的内容显示在屏幕上，并且不断刷新，使你看到最新的文件内容。
tail -f test.log，循环查看文件内容，Ctrl+c来终止
tail -n 5 test.log，显示文件最后5行内容
tail -n +5 test.log，从第5行开始显示文件
more
more [-dlfpcsu] [-num] [+/ pattern] [+linenum] [file...]
more命令和cat的功能一样都是查看文件里的内容，但有所不同的是more可以按页来查看文件的内容，还支持直接跳转行等功能。
more +3 test.log，显示文件中从第3行起的内容
more -5 test.log，设定每屏显示行数
ls -l | more -5，每页显示5个文件信息
more +/day3 test.log，查找第一个出现"day3"字符串的行，并从该处前两行开始显示输出
less
less [options] [file...]
与more命令一样，less命令也用来分屏显示文件的内容。但是二者存在差别：less命令允许用户向前或向后浏览文件，而more命令只能向前浏览。用less命令显示文件时，用PageUp键向上翻页，用PageDown键向下翻页。要退出less程序，应按Q键。
less test.log，查看文件
ps -ef | less，查看进程信息并通过less分页显示
history | less，查看命令历史使用记录并通过less分页显示
less test1.log test2.log，浏览多个文件，n和p切换文件
watch
watch [options] command
每隔一段时间重复运行一个命令，默认间隔时间是2秒。要运行的命令直接传给shell(注意引用和转义特殊字符)。结果会展示为全屏模式，这样你可以很方便的观察改变
watch -n 60 date，执行date命令每分钟一次，输入^C 退出
watch -d ls -l，查看目录变化
watch -d rsquo;ls -l | fgrep joersquo;，想找joe用户的文件
watch -d 'ls -l|grep scf'，监测当前目录中 scf' 的文件的变化
watch -n 10 'cat /proc/loadavg'，10秒一次输出系统的平均负载
watch -n 1 -d netstat -ant，每隔一秒高亮显示网络链接数的变化
watch -n 1 -d 'pstree | grep http'，每隔一秒高亮显示http链接数的变化
Linux常用命令三、文件相关
vi
vi file
按i键，进入编辑模式
按esc键，进入命令模式
:w 保存文件但不退出vi
:w file 将修改另外保存到file中，不退出vi
:w! 强制保存，不推出vi
:wq 保存文件并退出vi
:wq! 强制保存文件，并退出vi
q: 不保存文件，退出vi
:q! 不保存文件，强制退出vi
:e! 放弃所有修改，从上次保存文件开始再编辑
chmod
change mode，变更文件或目录的读、写、运行权限
chmod [-cfvR] [--help] [--version] mode file...
mode:权限设定字串，格式如下 : [ugoa...][[+-=][rw xX ]...][,...]
u 表示该档案的拥有者，g 表示与该档案的拥有者属于同一个群体(group)者，o 表示其他以外的人，a 表示这三者皆是
+ 表示增加权限、- 表示取消权限、= 表示唯一设定权限。
r 表示可读取，w 表示可写入，x 表示可执行，X 表示只有当该档案是个子目录或者该档案已经被设定过为可执行。
chmod也可以用数字来表示权限，语法为：chmod abc file，如chmod 777 file
其中a,b,c各为一个数字，分别表示User、Group、及Other的权限。 r=4，w=2，x=1
chmod 777 file，等同于 chmod a=rwx file
chmod ug=rwx,o=x file，等同于 chmod 771 file
chmod 4755 filename，可使此程序具有root的权限
ls -l 可以查看列出当前用户的文件权限
zip
zip -r filename.zip filesdir
zip -r test.zip ./_把当前所有文件压缩到test.zip
zip -r test.zip test，把test文件所有文件及目录，要是到test.zip
zip -d test.zip test.txt，删除压缩文件中test.txt文件
zip -m test.zip ./test.txt，向压缩文件中test.zip中添加test.txt文件
zip -r test.zip file1 file2 file3 filesdir，处理多个文件和目录，空格隔开
unzip
unzip zip-file，解压到当前目录
unzip -d dst-dir zip-file，解压到指定的目录，-d后为指定目录
unzip -n zip-file，不覆盖已经存在的文件，-n为不要覆盖原有的文件
unzip -n -d dst-dir zip-file，解压到指定的目录，不覆盖已经原有的文件
unzip -o -d dst-dir zip-file，-o不必先询问用户覆盖原有文件
unzip -l zip-file，仅查看压缩文件内所包含的文件
tar
tar cvf test.tar test，把test下所有文件和目录做备份tar czvf test.tar.gz test，把test下所有文件和目录做备份并进行压缩tar xzvf test.tar.gz，把这个备份文件还原并解压缩tar tvf test.tar | more，查看备份文件的内容，并以分屏方式显示在 显示器 上
tar czvf test.tar.gz test --exclude=test/svn，备份压缩并排除目录
touch
linux常用命令如下：
1、查看内核版本：uname -a。
2、控制台-》图形界面：init 5或者startx。
3、图形界面-》控制台: init3或者直接注销。
4、如何查看ip地址：ifconfig。
5、配置ip:ifconfig eth0 ip地址。
6、重启：reboot 或者 shutdown -r now。
7、普通用户切换到系统用户:su。
8、注销用户指令：logout。
9、从子机退出：ctrl+alt。
10、全屏：ctrl+alt+enter 。
基本思想：
Linux的基本思想有两点：第一，一切都是文件；第二，每个文件都有确定的用途。其中第一条详细来讲就是系统中的所有都归结为一个文件，包括命令、硬件和软件设备、操作系统、进程等等对于操作系统内核而言，都被视为拥有各自特性或类型的文件。
完全免费：
Linux是一款免费的操作系统，用户可以通过网络或其他途径免费获得，并可以任意修改其源代码。这是其他的操作系统所做不到的。正是由于这一点，来自全世界的无数程序员参与了Linux的修改、编写工作，程序员可以根据自己的兴趣和灵感对其进行改变，吸收了无数程序员的精华。
以上内容参考：百度百科--Linux
linux基本操作命令如下：
1、查看内核版本：uname -a。
2、控制台-图形界面：init 5或者startx。
3、图形界面-控制台: init3或者直接注销。
4、如何查看ip地址：ifconfig。
5、配置ip:ifconfig eth0 ip地址。
6、重启：reboot 或者 shutdown -r now。
linux常用命令举例
cd命令这是一个非常基本，也是大家经常需要使用的命令，它用于切换当前目录，它的参数是要切换到的目录的路径，可以是绝对路径，也可以是相对路径，如cd/root/Docements#切换到目录/root/Docementscd./path#切换到当前目录下的path目录中。
这是一个非常有用的查看文件与目录的命令，list之意，它的参数非常多，下面就列出一些我常用的参数吧，如下，l，列出长数据串，包含文件的属性与权限数据等a，列出全部的文件连同隐藏文件一起列出来d，仅列出目录本身，而不是列出目录的文件数据h，将文件容量以较易读的方式列出来R。