【R语言】解决GO富集分析绘图,标签重叠问题

最近有粉丝反映说，利用clusterProfiler这个包绘制GO富集分析气泡图和柱形图的时候，发现GO条目的名字都重叠在一起了。气泡图 柱形图 这个图别说美观了，简直不忍直视。经过我的认真研究，发现跟R版本有关。

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但是该方法存在一个很大的问题，那就是当x轴标签数量很多时，那么就无法通过这样的方法进行解决了。方法二是方法一的逆向思路，既然可以调大画布，那么反过来，我们也可以调小x轴标签字体。

最近小Q在做自然选择分析，分析完之后简单粗暴的对候选基因做了富集分析，并做了展示，比起气泡图，我模仿了另一种作图方式，显示效果更佳。所以想在此分享一下如何用R语言画富集分析示意图（非气泡图）。

在是否需要构建的问题上，我看到徐洲更在 功能注释后如何做富集分析 中提到 “你不需要构建Orgdb，因为Orgdb的用途是进行基因编号和GO/KEGG的转换。

单细胞富集分析我最常用的是 分组GSVA ，但最近用到了GO分析，就复习一下GO和KEGG富集分析及绘图。载入无比熟悉的pbmc.3k数据集 (已注释好，数据准备见 monocle )pbmc3k数据集只有1个样本，没办法区分HC和病例组。

go配置环境

也可以使用下面的命令，省去每次调用gvm use的麻烦： gvm use go17 --default 执行完上面的命令之后GOPATH、GOROOT等环境变量会自动设置好，这样就可以直接使用了。

用配置。最新版go还是需要进行环境变量配置的，否则无法正常使用。环境变量是一个动态命名的值，可以影响运行进程在计算机上的行为方式。

1 Go 安装 Go的三种安装方式 Go有多种安装方式，你可以选择自己喜欢的。这里我们介绍三种最常见的安装方式： Go源码安装：这是一种标准的软件安装方式。

新手请问Go语言中包的问题

1、go语言 一个主package包引入同级目录下go文件包编译出错是设置错误造成的，解决方法为：先使用import strings导入strings库。HasPrefix 判断字符串 s 是否以 prefix 开头。

2、go.mod 文件中指定的依赖列表的版本。对于更上一层的编译，其他导入这个模块的地方将使用它较新的版本编译。包发布者最好使用语义化的 tag 发布版本，vgo 也鼓励通过打tag的版本号方式，而不是任意的提交版本。

3、go语言中main包是特殊的。一般的包名是.go文件的目录名，编译器会将同一目录下的不同.go文件视作同一个包。

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