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通常，我们需要设置三个环境变量：Java_HOME、PATH 和 CLASSPATH。
JAVA_HOME：该环境变量的值就是 Java 所在的目录，一些 Java 版的软件和一些 Java 的工具需要用到该变量，设置 PATH 和 CLASSPATH 的时候，也可以使用该变量以方便设置。
PATH：指定一个路径列表，用于搜索可执行文件的。执行一个可执行文件时，如果该文件不能在当前路径下找到，则依次寻找 PATH 中的每一个路径，直至找到。或者找完 PATH 中的路径也不能找到，则报错。Java 的编译命令 (javac)，执行命令 (java) 和一些工具命令 (javadoc, jdb 等) 都在其安装路径下的 bin 目录中。因此我们应该将该路径添加到 PATH 变量中。
CLASSPATH：也指定一个路径列表，是用于搜索 Java 编译或者运行时需要用到的类。在 CLASSPATH 列表中除了可以包含路径外，还可以包含 .jar 文件。Java 查找类时会把这个 .jar 文件当作一个目录来进行查找。通常，我们需要把 jdk 安装路径下的 jrelibrt.jar (Linux: jre/lib/rt.jar) 包含在 CLASSPATH 中。
PATH 和 CLASSPATH 都指定路径列表，列表中的各项 (即各个路径) 之间使用分隔符分隔。在 windows 下，分隔符是分号 (;)，而在 Linux 下，分隔符是冒号 (:)。
下面分别说明三个环境变量在 Windows 和 Linux 下如何设置，不过在此之前，我们需要做个假设。假设 JDK 在 Windows 下的安装路径是 C:jdk，在 Linux 下的安装路径是 /usr/local/jdk/。那么，安装后的 JDK 至少会包括如下内容：
C:jdk (/usr/local/jdk)
|-- bin
|-- demo
|-- include
|-- jre
| |-- bin
| `-- lib
`-- lib
***** 在 Windows 下设置
Windows 下使用 set 命令设置环境变量，为了使每一次启动计算机都设置这些环境变量，应该在系统盘根目录下的 autoexec.bat 文件中进行设置，如：
set JAVA_HOME=C:jdk
set PATH=%JAVA_HOME%bin;C:Windows;C:WindowsCommand
set CLASSPATH=%JAVA_HOME%jrelibrt.jar;.
有些版本的 Windows 不能用 %变量名% 来替换环境变量的内容，那么就只好直接写 C:jdk 而不是 %JAVA_HOME% 了。另外，C:Windows 和 C:WindowsCommand 是 Windows 会自动加入路径的，所以可以从设置中去掉。如果在 autoexec.bat 中已经设置了 PATH，那只需要将 %JAVA_HOME%bin 加到原来设置 PATH 的那条语句中就行了。
CLASSPATH 也可以根据需要设置或者加入其它的路径，比如你想把自己写的一些类放在 C:java 中，就可以把 C:java 也添加到 CLASSPATH 中去，set CLASSPATH=%JAVA_HOME%jrelibrt.jar;C:java;.。
注意，在 CLASSPATH 中包含了一个“当前目录 (.)”。包含了该目录后，就可以到任意目录下去执行需要用到该目录下某个类的 Java 程序，即使该路径并未包含在 CLASSPATH 中也可以。原因很简单：虽然没有明确的把该路径包含在 CLASSPATH 中，但 CLASSPATH 中的 “.” 在此时就代表了该路径，如：
假设在 C:java 目录下有可运行的类 HelloJava.class，那么
C:> set CLASSPATH=C:jdkjrelibrt.jar;. // 设置 CLASSPATH 环境变量，注意最后有一个 “.”
C:> cd java // 转到 C:java 目录
C:java> java HelloJava // 运行 HelloJava
Hello, Java. // 运行结果
C:java> _
该例将在 1.3.3 节中分析。
**** 在 Linux 下设置
Linux 下使用“变量名=变量值”设置变量，并使用 export 命令将其导出为环境变量。为了使每一次登录都自动设置好这些变量，你需要在 ~/.bash_profile 里或者 ~./bashrc 里进行设置，如
export JAVA_HOME=/usr/local/jdk
export PATH=$JAVA_HOME/bin:$PATH
export CLASSPATH=$JAVA_HOME/jre/lib/rt.jar:.
设置 PATH 时用的 $JAVA_HOME 是指替换变量 JAVA_HOME 的值到 $JAVA_HOME 所在位置。如上句实际就是 export PATH=/usr/local/jdk/bin:$PATH。这句中 $PATH 也是同样的作用，不过这里的 PATH 是指以前设置的 PATH 变量的值，而非本次设置 PATH 变量的值。
注意，在 CLASSPATH 中包含了一个“当前目录 (.)”。包含了该目录后，就可以到任意目录下去执行需要用到该目录下某个类的 Java 程序，即使该路径并未包含在 CLASSPATH 中也可以。原因很简单：虽然没有明确的把该路径包含在 CLASSPATH 中，但 CLASSPATH 中的 “.” 在此时就代表了该路径，例如
假设在 /home/fancy/java 目录下有可运行的类 HelloJava.class，那么
[fancy@matrix fancy]$ export CLASSPATH=/usr/local/jdk/jre/lib/rt.jar:. // 设置 CLASSPATH，注意最后的“.”
[fancy@matrix fancy]$ cd ~/java // 转到 /home/fancy/java
[fancy@matrix java]$ pwd // 显示当前目录
/home/fancy/java // 当前目录是 /home/fancy/java
[fancy@matrix java]$ java HelloJava // 运行 HelloJava
Hello, Java // 运行结果
[fancy@matrix java]$ _
该例将在 1.3.3 节中分析
***** 实例分析
1.3.1 节和 1.3.2 节中的用到的实际上是一样的例子，只是操作系统不同，略有差别。
两个例子都提到一个“可运行的类”，它是指包含了 public static void main(String[] args) 方法的类，这将在下一章 HelloJava 一节中详述。例中的 CLASSPATH 均未包含 HelloJava.class 所在的目录(C:java, /home/fancy/java)，但是均包含了当前目录 (.)。因此转到包含 HelloJava.class 的目录下去执行 java HelloJava，在 Java 寻找到 CLASSPATH 中的“. (当前目录，C:java, /home/fancy/java)”时，找到了 HelloJava.class，运行成功。